目前國內除了本所和設置於本校之台灣溫泉研究發展中心是完全投入溫泉領域之研究外，其餘國內有關溫泉研究的學系，大都僅止於個別研究室之研究興趣，對溫泉全方位之研究與整合效率有限。若依現今國內學界參與溫泉研究之學系歸類，大致上可分三類：
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溫泉技術研發類，如環境資源管理、環境工程、資源工程、地質、地球科學、水利工程學等相關系所。
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溫泉產業經營管理類，休閒觀光、企業管理、飯店餐飲、都市計畫、建築景觀、公共事務等相關系所。
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多元利用類：物理治療、化妝品美容、應用空間資訊、文化產業、職業安全等相關系所。
本所成立不僅配合溫泉產官學現況，訂定明確之發展與研究方向，也因研究方向多元，並涉及溫泉資源整合與多元技術研發，具有引導國內溫泉產官學整合與釐清國內溫泉發展方向的重要角色。本所成立當可激發並帶動國內更多研究單位實質投入溫泉之研究與技術研發行列。因此，若能在學界將資源與技術類領域及規劃與管理領域整合，促成不同領域間的專家學者交流合作，培養溫泉研究與管理的高級人才，應是提昇國內溫泉產業經營的有效方案。
本所為能實質協助推展台灣溫泉產業之研發技術和經營技術，特將教育目標設定為培養學生成為溫泉相關產業之專業技術研發及管理經營人才，研究涉及層面包括(1)溫泉多元應用技術、(2)溫泉健康促進技術、(3)泉質分析應用再生技術、(4)溫泉探勘及取量技術、(5)溫泉開發及規劃技術、(6)溫泉經營管理技術、(7)法規與發展趨勢評估技術等，並積極協助政府和產業在溫泉水質及管理技術、溫泉高值產品技術、溫泉健康促進技術已有了指標性研究成果。
本所發展目標（註解說明如下）：
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管理經營能力：含溫泉產業文化與經濟分析技能、溫泉區環境開發與與技能、溫泉休憩空間規劃與設計、人力資源管理、溫泉泉質管理技術、溫泉產業電子商務及溫泉資訊管理技術，實質以學術之研發與教學傳授，有效將溫泉產業經營管理技能直接導入產業層面，協助推展台灣溫泉產業經營管理能力。
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高度的企劃力：以專題討論、論文及溫泉個案企劃研究，培養學生產業實務的企劃能力，提昇業界開發及發展特色專案之專業企劃。
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相關規範與驗證技術：本所實務研究量能具體，成果可以直接提供產業發展需求，包括水質檢測技術與驗證管理、高值溫泉多元產品研發技術與驗證、溫泉健康促進泡湯手冊等成果，可直接協助產業發展。
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專業證照與人才培訓：培育「溫泉產業經營管理」與「溫泉技術研發」之專業經理人才為本所課程設計核心，透過課程教導完成產業迫切之專業指導人員技能訓練，包含溫泉泉質管理、溫泉健康促進專業指導、溫泉保養地之健康指導領隊訓練，協助產業培訓專業人才。其他國際認證的管理證照，本所亦積極鼓勵學生取得，例如英國CITY&GUILDS 服務類國際證照-台灣師資認證班(行銷管理師、顧客關係管理師、衝突管理專業人才)，於97、98年度已多位學生取得。為達成目標所採取的策略及具體落實情形。