近年來本所教師結合本校溫泉中心相關人員已完成輔導或合作溫泉業者申辦合格取供與使用溫泉之業者（有輔導及合作資料）共有四十餘家，顯示本所跟台灣各區域溫泉業者已有緊密之合作關係，包括：
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北區：紗帽谷溫泉美食餐廳、菁山遊憩區、八煙溫泉會館、舊金山總督溫泉、巨龍渡假山莊、新竹清泉溫泉、錦水溫泉飯店、騰龍溫泉山莊、日出溫泉會館、虎山溫泉會館、竹美山閣溫泉會館、泰安觀止溫泉會館、湯悅溫泉會館、湯唯溫泉會館。
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中區：麒麟峰溫泉、台中日光溫泉會館、伊豆日式露天溫泉會館、碧綠大飯店、帝綸溫泉飯店。
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南區：景大山莊、關子嶺統茂溫泉會館、龜丹休閒體驗農園、石洞溫泉山莊、美崙山溫泉渡假村、七坑溫泉、清泉溫泉山莊、南台灣觀光大飯店。
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東區：天隆大飯店、礁溪老爺大酒店、安通溫泉飯店、吉祥農莊、瑞雄溫泉旅館、東台溫泉飯店、泓泉溫泉渡假村、知本統茂溫泉旅館、知本富野渡假村、丫一丫旺溫泉渡假村、東遊季溫泉渡假村、金帥旅社、東太陽、椰璽、富之山、太平洋、米之谷、丹堤、遠山工夫、美之濱。